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03/16/2015 - 03/19/2015 | Erlangen

Protein-Modellierung – von der Sequenz zur Struktur

Dieser Weiterbildungskurs gibt einen Überblick über aktuell in der Forschung verwendete theoretische Konzepte und Lösungsoptionen zur Beschreibung biologischer Makromoleküle. Er richtet sich an Naturwissenschaftler, Chemiker, Biologen, Mediziner, Biotechnologen und Pharmazeuten in Forschung und Entwicklung.

Der Anstieg von Kosten sowie experimentellem Aufwand führt dazu, dass theoretische Verfahren besonders in der pharmazeutischen und medizinisch-technischen Chemie zunehmend an Bedeutung gewinnen. Angesichs der Vielfalt der Software, die mittlerweile für die verschiedensten Einsatzgebiete zur Verfügung steht, ist eine Spezialisierung auf Teilbereiche fast unumgänglich. Dabei kann zwischen makroskopischen Systemen (z.B. Proteine oder DNS) sowie kleinen Molekülen (organische und anorganische Verbindungen) unterschieden werden.

Ein Schwerpunkt liegt auf der Behandlung von Proteinstrukturen. Ausgehend von einer gegebenen Aminosäuresequenz für ein Peptid oder Protein sollen Informationen über familiäre Zusammenhänge, mögliche Sekundärstrukturen bis hin zur dreidimensionalen Geometrie analysiert oder neu berechnet werden.
Methoden zum Auffinden und Vergleichen von homologen Sequenzabschnitten, Sequenzalignments sowie die Strukturmodellierung auf Grundlage bekannter Geometrien homologer Systeme werden diskutiert und vorgestellt. Speziell für Proteine geht der Kurs auf Verfahren wie Geometrieoptimierungen sowie zeitabhängige Untersuchungen via Moleküldynamik-Simulationen und deren Analysemöglichkeiten ein. Besonderer Wert liegt auf der Visualisierung von Proteinstrukturen und deren Eigenschaften. Der Einfluss des Alignments auf die resultierenden Strukturmodelle wird an praktischen Beispielen demonstriert.

Information on participating / attending:

Date:

03/16/2015 - 03/19/2015

Event venue:

Computer-Chemie-Centrum
Universität Erlangen-Nürnberg
Nägelsbachstr. 25
91052 Erlangen
Bayern
Germany

Target group:

Scientists and scholars

Email address:

Relevance:

transregional, national

Subject areas:

Biology, Chemistry

Types of events:

Seminar / workshop / discussion

Entry:

12/10/2014

Sender/author:

Dr. Christine Dillmann

Department:

Öffentlichkeitsarbeit

Event is free:

no

Language of the text:

German

URL of this event: http://idw-online.de/en/event49470


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