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Greifswalder Publikation in der Fachzeitschrift Nucleic Acids Research
Ein Forschungsteam der Universitätsmedizin Greifswald hat ein neues Verfahren entwickelt, mit dem man regulatorische DNA-Sequenzen, die für die Genexpression entscheidend sind, in einer lebenden Zelle verfolgen und charakterisieren kann.
Das bedeutet, dass der regulatorische Prozess, durch den die in einem Gen enthaltene Information genutzt wird, um zum Beispiel ein Protein herzustellen, genau überwacht und der Regulationsmechanismus nun in einer lebenden Zelle untersucht werden kann. Dafür hat das Team ein genetisches Konstrukt aufgebaut, das mittels Floreszenz-Messung die Genregulation über einen längeren Zeitraum messbar macht. In bisherigen Verfahren werden Zellen zunächst getötet, bevor sie überwacht werden können. Die neuartige Methode wurde nun in der Fachzeitschrift Nucleic Acids Research vorgestellt.
„Unser neu entwickeltes Verfahren lässt sich universell anwenden“, betont Dr. Alexander Reder, wissenschaftlicher Mitarbeiter am Interfakultären Institut für Genetik und Funktionelle Genomforschung. „Was wir erfolgreich anhand eines Modell-Bakteriums angewendet haben, lässt sich im Prinzip auf jede andere Zelle übertragen.“ Damit zeige sich, welche Bedeutung diese Ergebnisse aus der Grundlagenforschung für die Anwendung in der Praxis haben können: „Mit dem System ließen sich zum Beispiel Punktmutationen in bestimmten regulatorischen Sequenzen untersuchen, die im Zusammenhang mit veränderter Genexpression seltener Erkrankungen stehen“, so Reder weiter.
Die neue Methode hat gleich mehrere Vorteile: Sie ist schnell, präzise und liefert Ergebnisse in lebenden Zellen – ohne aufwendige Probenvorbereitungen und teure OMICS-Verfahren. Bisher müssen Zellen zunächst getötet werden, bevor die Proteine oder RNA isoliert und schließlich mittels verschiedener Methoden wie beispielsweise Transkriptom- oder Proteom-Technologien untersucht werden können. Diese Abläufe seien teilweise sehr zeitintensiv, wenig flexibel und spiegeln nicht das reale Bild wider, was in einer einzelnen Zelle passiert. Ein großes Problem bestehe auch darin, den zeitlichen Ablauf zu verfolgen: „Wenn man die Zellen zu einem bestimmten Zeitpunkt getötet hat, wäre der Ist-Zustand zwar zunächst messbar – fünf Minuten später oder am nächsten Tag ist er allerdings nicht mehr beobachtbar“, erklärt Reder.
Das neue Konstrukt ist da anders: Es handelt sich um das sogenannte pHIS-Plasmidsystem und funktioniert mittels zweier Reportergene, die in einer Floreszenz-Messung grün oder blau aufleuchten. Auf diese Weise kann man die von zwei regulatorischen Bereichen gesteuerten Zustände der Genexpressionen, die innerhalb der lebenden Zelle stattfinden, in Echtzeit beobachten. Der Trick besteht darin, dass das erste „blaue“ Reportergen durch einen „normalen“ regulatorischen Bereich kontrolliert wird. Man kann dann spezifische Sequenzveränderungen in eben diese Sequenz einbauen und diese vor das zweite „grüne“ Reportergen setzen. So hat man eine interne Kontrolle (blau), die man in direkten Vergleich zur mutierten beziehungsweise fehlerhaften Genexpression setzen kann. „Man kann auch unterschiedliche Stimuli einsetzen“, so Reder, „das heißt, man kann Zellen unter Kontrollbedingungen wachsen lassen oder auch einem Stress aussetzen – zum Beispiel einem Alkohol-, Salz- oder Kälte-Stress“. Dadurch könne man parallel ganz unterschiedliche Bedingungen untersuchen und damit ein besseres Verständnis von Genen und deren Regulationsmechanismen bekommen.
Die Forschungsergebnisse wurden nun in der Fachzeitschrift Nucleic Acids Research veröffentlicht. „Das neue pHIS-System ist nicht nur ein wichtiger Fortschritt in der Grundlagenforschung, sondern wird auch eine wesentliche Rolle bei der praktischen Anwendung spielen – etwa in der Medizin, in der Biotechnologie oder im Bereich der Medikamentenentwicklung“, wie Prof. Karlhans Endlich, Wissenschaftlicher Vorstand der Unimedizin Greifswald, betont. Das System helfe zu verstehen, wie Bakterien auf Stress – zum Beispiel durch Antibiotika – reagieren. „Wenn wir wissen, welche Gene bei Angriffen hochgefahren werden, können neue Medikamente gezielt diese Schutzmechanismen blockieren – und so Resistenzen bekämpfen“, so Endlich.
Universitätsmedizin Greifswald
Stabsstelle Kommunikation und Marketing
Katrin Kleedehn
Wissenschaftsredakteurin
Tel: +49 3834 86 – 6521
katrin.kleedehn@med.uni-greifswald.de
http://www.medizin.uni-greifswald.de
Dr. Alexander Reder
phone +49 (0)3834 420 5822
redera@uni-greifswald.de
Characterization of the MgsR-dependent promoter structure in Bacillus subtilis—application of a novel pHIS plasmid-based screening system for promoter element analysis
https://academic.oup.com/nar/article/53/13/gkaf636/8196072
Nucleic Acids Research, Volume 53, Issue 13, 22 July 2025
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf636
Dr. Alexander Reder (li.) und Marco Harms haben in der Fachzeitschrift Nucleic Acids Rese-arch ein n ...
Source: Foto: Tilly Hoffmüller
Copyright: Unimedizin Greifswald
Criteria of this press release:
Journalists, Scientists and scholars
Biology, Chemistry, Medicine
transregional, national
Research results, Scientific Publications
German
Dr. Alexander Reder (li.) und Marco Harms haben in der Fachzeitschrift Nucleic Acids Rese-arch ein n ...
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